A csernobili katasztrófa nem csak az egykori Szovjetúnióban, hanem az egész világon az egyik legnagyobb hatású tragédia a történelemben. A Magyar Csernobil elsősorban a magyar hatásokra, következményekre koncentrál, azokat a magyar sorsokat mutatja be, akiknek az élete közvetlenül összekapcsolódik a csernobili katasztrófával. Újságírók, tudósok, kamionsofőrök, orvosok és likvidátorok. Ők azok a magyarok, akik akaratlanul is közvetlen szereplői lettek ennek a történelmi katasztrófának.